1956年，环境工程系由迁校合并的原东北工学院供热供煤气与通风专业的教工和二、三、四年级学生，以及青岛工学院、西北工学院、和苏南工专的部分教师组建而成，原称“卫生工程系”。设有“供热供煤气与通风工程”和“给水排水工程”两个专业。

1977年，“三废治理与综合利用”专业，作为我国首批建立的环境工程类专业开始招生。

1979年，建筑热能工程（供热供燃气通风及空调工程）学科，开始招收“空气调节”方向研究生。

1980年，卫生工程系更名为环境工程系，三废治理与综合利用专业更名为环境保护专业。环境工程学科首次招收“水处理”方向研究生。

1983年，环保专业更名为环境工程专业。

1984年，建筑热能工程学科与环境工程学科经国务院学位委员会批准获硕士学位授予权。

1993年，经国务院学位委员会批准，建立市政工程学科硕士点、取得市政工程学科硕士学位授予权。

1996年，经国务院学位委员会批准，环境工程学科取得博士学位授予权。

1998年，供热·供燃气·通风与空调工程取得博士学位授予权。

1999年，环境工程专业更名为环境与市政工程学院。环境科学专业正式成立。

2000年，获准建立环境科学与工程博士后科研流动站。市政工程学科取得博士学位授予权。

2002年，环境工程国家重点学科评审通过。